Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP4R2Q9NY27 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP4R2Q9NY27 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms