Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms