Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCLQ9NW38 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms