Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM28Q9NW13 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM28Q9NW13 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms