Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINM1Q9NU53 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms