Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms