Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2B1Q9NRF2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms