Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms