Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC17Q9NP64 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC17Q9NP64 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms