Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms