Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM3Q9BZL3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms