Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms