Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PBDC1Q9BVG4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms