Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF23Q9BUL5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF23Q9BUL5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms