Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TIMM29Q9BSF4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM29Q9BSF4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms