Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GINS3Q9BRX5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms