Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms