Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms