Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIN2AQ99865 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN2AQ99865 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms