Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYD88Q99836 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms