Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEIS3Q99687 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3Q99687 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms