Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAF11Q99590 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF11Q99590 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms