Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARXQ96QS3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARXQ96QS3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms