Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms