Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A9Q96Q91 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms