Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms