Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms