Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SUSD3Q96L08 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD3Q96L08 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms