Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms