Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms