Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED3Q96IU2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED3Q96IU2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms