Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPNQ96H22 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPNQ96H22 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms