Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OMA1Q96E52 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OMA1Q96E52 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms