Protein–RNA interactions for Protein: Q96D96

HVCN1, Voltage-gated hydrogen channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1Q96D96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HVCN1Q96D96 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HVCN1Q96D96 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms