Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPRTQ96BW1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms