Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRF1Q92994 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRF1Q92994 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms