Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CELF1Q92879 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF1Q92879 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms