Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms