Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIPC3Q8TF64 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms