Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms