Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA6DQ8NFY4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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