Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CLDN19Q8N6F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLDN19Q8N6F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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CLDN19Q8N6F1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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CLDN19Q8N6F1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CLDN19Q8N6F1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLDN19Q8N6F1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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