Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NME8Q8N427 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NME8Q8N427 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME8Q8N427 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms