Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVBPQ8N300 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms