Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4DQ86TL0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms