Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9AQ7Z3C6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG9AQ7Z3C6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms