Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms