Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTL4Q6ZR62 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RTL4Q6ZR62 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms