Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms