Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4L9Q6RFH8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms